Генетические дефекты у пациентов с первичными иммунодефицитами в Республике Беларусь

Белевцев М. В.; Пугачёва В. В.; Гурьянова И. Е.; Полякова Е. А.; Мигас А. А.; Хурс О. М.; Шарапова С. О.; Сакович И. С.; Алешкевич С. Н.; Жаранкова Ю. С.; Углова Т. А.; Алейникова О. В.

Генетические дефекты у пациентов с первичными иммунодефицитами в Республике Беларусь

2020

https://doi.org/10.29235/1814-6023-2020-17-2-221-236

Первичные иммунодефициты (ПИД) – это обширная гетерогенная группа генетически обусловленных заболеваний, характеризующихся разнообразными нарушениями в работе иммунной системы. Типичными признаками ПИД являются ранняя манифестация, тяжелое течение, высокая летальность.Генетически подтвержденный диагноз ПИД выставлен 191 пациенту (120 мужчинам и 71 женщине). Генетически верифицированные ПИД представлены 25 нозологиями. Помимо уже описанных другими авторами мутаций нами выявлены новые мутации, которые связывают с развитием ПИД. Всего нами выявлено 32 новые мутации, которые не были описаны ранее в литературе и онлайн-базах данных, из них 13 мутаций приводили к сдвигу рамки считывания и синтезу укороченного белка, функциональная активность которого была изменена. Среди выявленных нами новых мутаций на втором месте по частоте встречаемости были миссенс-мутации (п = 11). Мутации этого типа приводят к трансформации аминокислотной последовательности белка, что в свою очередь изменяет его структуру, а также функциональную активность.

Белевцев М. В., Пугачёва В. В., Гурьянова И. Е., Полякова Е. А., Мигас А. А., Хурс О. М., Шарапова С. О., Сакович И. С., Алешкевич С. Н., Жаранкова Ю. С., Углова Т. А., Алейникова О. В. Генетические дефекты у пациентов с первичными иммунодефицитами в Республике Беларусь. Известия Национальной академии наук Беларуси. Серия медицинских наук. 2020;17(2):221-236. https://doi.org/10.29235/1814-6023-2020-17-2-221-236

Цитирование

Список литературы

1. International Union of Immunological Societies: 2017 Primary Immunodeficiency Diseases Committee Report on Inborn Errors of Immunity / C. Picard [et al.] // J. Clin. Immunol. – 2018. – Vol. 38, N 1. – P. 96–128. https://doi.org/10.1007/s10875-017-0464-9

2. Ensembl genome browser 95 [Electronic resource]. –Mode of access : http://www.ensembl.org/index.html. – Date of access : 03.12.2019.

3. Protein structure analysis of mutations causing inheritable diseases. An e-Science approach with life scientist friendly interfaces / H. Venselaar [et al.] // BMC Bioinformatics. – 2010. – Vol. 11, N 1. – Art. 548. https://doi.org/10.1186/1471-2105- 11-548

4. Руководство по интерпретации данных последовательности ДНК человека, полученных методами массового параллельного секвенирования (MPS) (редакция 2018, версия 2) / О. П. Рыжкова [и др.] // Мед. генетика. – 2019. – Т. 18, № 2. – С. 3–23.

5. Политыко, А. Д. Геномные болезни человека. Анализ локуса 22q11 / А. Д. Политыко, О. М. Хурс, Т. Лир // Молек. и прикл. генетика. – 2009. – Т. 10. – С. 80–88.

6. Исследование компонентов системы комплемента в дифференциальной диагностике врожденного (наследственного) ангионевротического отека / И. Е. Гурьянова [и др.] // Лаб. диагностика. Вост. Европа. – 2019. – Т. 8, № 4. – С. 553–564.

7. Heterozygous FOXN1 variants cause low TRECs and severe T cell lymphopenia, revealing a crucial role of FOXN1 in supporting early thymopoiesis / M. Bosticardo [et al.] // Am. J. Hum. Genet. – 2019. – Vol. 105, N 3. – P. 549–561. https://doi.org/10.1016/j.ajhg.2019.07.014

8. Late-onset combined immune deficiency associated to skin granuloma due to heterozygous compound mutations in RAG1 gene in a 14 years old male / S. O. Sharapova [et al.] // Hum. Immunol. – 2013. – Vol. 74, N 1. – P. 18–22. https://doi.org/10.1016/j.humimm.2012.10.010

9. Генотип-фенотипическая характеристика пациентов с синдромом Вискотт-Олдрич / С. О. Шарапова [и др.] // Проблемы здоровья и экологии. – 2011. – № 2. – С. 95–97.

10. Primary immunodeficienciecy mutation databases / M. Vihnen [et al.] // Adv. Genet. – 2001. – Vol. 43. – P. 103–108. https://doi.org/10.1016/s0065-2660(01)43005-7

11. Mutations of the Wiskott-Aldrich syndrome protein (WASP): hotspots, effect on transcription, and translation and phenotype/genotype correlation / Y. Jin [et al.] // Blood. – 2004. – Vol. 104, N 13. – P. 4010–4019. https://doi.org/10.1182/blood-2003-05-1592

12. Thrasher, A. J. New insights into the biology of Wiskott-Aldrich syndrome (WAS) / A. J. Thrasher // Hematol. Am. Soc. Hematol. Educ. Program. – 2009. – Vol. 2009, N 1. – P. 132–138. https://doi.org/10.1182/asheducation-2009.1.132

13. ATM mutations on distinct SNP and STR haplotypes in ataxia-telangiectasia patients of differing ethnicities reveal ancestral founder effects / С. Campbell [et al.] // Hum. Mutat. – 2003. – Vol. 21, N 1. – P. 80–85. https://doi.org/10.1002/humu.10156

14. Perlman, S. Ataxia-Telangiectasia: diagnosis and treatment / S. Perlman, S. Becker-Catania, A. R. Gatti // Semin. Pediatr. Neurol. – 2003. – Vol. 10, N 3. – P. 173–182. https://doi.org/10.1016/s1071-9091(03)00026-3

15. Chun, H. H. Ataxia-telangiectasia, an evolving phenotype/ H. H. Chun, R. A. Gatti // DNA Repair (Amst.). – 2004. – Vol. 3, N 8–9. – P. 1187–1196. https://doi.org/10.1016/j.dnarep.2004.04.010

16. Novel biallelic ATM mutations coexist with a mosaic form of triple X syndrome in an 11-year-old girl at remission after T cell acute leukemia / S. O. Sharapova [et al.] // Immunogenetics. – 2018. – Vol. 70, N 9. – P. 613–617. https://doi.org/10.1007/s00251-018-1056-4

17. Иммунологический статус детей с врожденной агаммаглобулинемией / С. О. Шарапова [и др.] // Вес. Нац. aкад. навук Беларусі. Сер. мед. навук. – 2013. – № 2. – С. 19–29.

18. Valiaho, J. BTKbase: the mutation database for X-linked agammaglobulinemia / J. Valiaho, E. Smith, M. Vihinen // Hum. Mutat. – 2006. – Vol. 27, N 12. – P. 1209–1217. https://doi.org/10.1002/humu.20410

19. A genotype-phenotype correlation study in a group of 54 patients with X-linked agammaglobulinemia / E. LopezGrandos [et al.] // J. Allergy Clin. Immunol. – 2005. – Vol. 116, N 3. – P. 690–697. https://doi.org/10.1016/j.jaci.2005.04.043

20. Genetic and demographic features of X-linked agammaglobulinemia in Eastern and Central Europe A cohort study / B. Toth [et al.] // Mol. Immunol. – 2009. – Vol. 46, N 10. – P. 2140–2146. https://doi.org/10.1016/j.molimm.2009.03.012

21. Michalovich, D. Activated PI3 kinase delta syndrome: from genetics to therapy / D. Michalovich, S. Nejentsev // Front. Immunol. – 2018. – Vol. 9. – Art. 369. https://doi.org/10.3389/fimmu.2018.00369

22. PI3Kδ and primary immunodeficiencies / C. Lucas [et al.] // Nat. Rev. Immunol. – 2016. – Vol. 16, N 11. – P. 702–714. https://doi.org/10.1038/nri.2016.93

23. CYBB mutation analysis in X-linked chronic granulomatous disease / O. Jirapongsananuruk [et al.] // Clin. Immunol. – 2002. – Vol. 104, N 1. – P. 73–76. https://doi.org/10.1006/clim.2002.5230

24. Hematologically important mutations: X-linked chronic granulomatous disease (third update) / D. Roos [et al.] // Blood Cells Mol. Dis. – 2010. – Vol. 45, N 3. – P. 246–265. https://doi.org/10.1016/j.bcmd.2010.07.012

25. Novel LRBA mutation and possible germinal mosaicism in a Slavic family / S. O. Sharapova [et al.] // J. Clin. Immunol. – 2018. – Vol. 38, N 4. – P. 471–474. https://doi.org/10.1007/s10875-018-0515-x

Источник

Информация

Автор

Белевцев М. В. Республиканский научно-практический центр детской онкологии, гематологии и иммунологии
Пугачёва В. В. Республиканский научно-практический центр детской онкологии, гематологии и иммунологии
Гурьянова И. Е. Республиканский научно-практический центр детской онкологии, гематологии и иммунологии
Полякова Е. А. Республиканский научно-практический центр детской онкологии, гематологии и иммунологии
Мигас А. А. Республиканский научно-практический центр детской онкологии, гематологии и иммунологии
Хурс О. М. Республиканский научно-практический центр «Мать и дитя»
Шарапова С. О. Республиканский научно-практический центр детской онкологии, гематологии и иммунологии
Сакович И. С. Республиканский научно-практический центр детской онкологии, гематологии и иммунологии
Алешкевич С. Н. Республиканский научно-практический центр детской онкологии, гематологии и иммунологии
Жаранкова Ю. С. Республиканский научно-практический центр детской онкологии, гематологии и иммунологии
Углова Т. А. Республиканский научно-практический центр детской онкологии, гематологии и иммунологии
Алейникова О. В. Республиканский научно-практический центр детской онкологии, гематологии и иммунологии

Страницы

221-236

Год издания

2020

Ключевые слова

Коллекции

Известия Национальной академии наук Беларуси. Серия медицинских наук