In vitro и in siliko oценка взаимодействия сывороточного альбумина человека с омега-3-6-9 жирными кислотами

Valojerdi F. M.; Farasat A.; Gheibi N.

In vitro и in siliko oценка взаимодействия сывороточного альбумина человека с омега-3-6-9 жирными кислотами

Valojerdi F. M., Farasat A. , Gheibi N.

2021

Взаимодействие между сывороточным альбумином человека (САЧ) и омега-3, омега-6 и омега-9 жирными кислотами как ненасыщенными жирными кислотами исследовано методами спектрофотометрии в УФ-видимом диапазоне, спектроскопии кругового дихроизма (КД), иммуноферментного анализа (ELISA), измерения времени жизни и анизотропии флуоресценции, а также моделирования визуальной молекулярной динамики (МД). Термодинамические параметры термической и химической денатурации САЧ оценивали в присутствии омега-3-6-9 жирных кислот и без них. Для чистого САЧ (298 K) Tm = 327.7 K и ΔG0 = 88 кДж/моль, при обработке САЧ 10 мкМ омега-3, омега-6 и омега-9 Tm и ΔG0 составили 326.2 и 87, 319.07 и 87 и 313.23 К и 86 кДж/моль соответственно. Такое же снижение свободной энергии Гиббса, которая является критерием стабильности белка, достигнуто при химической денатурации мочевиной в присутствии омега 3-6-9 жирных кислот. Взаимодействие омега 3-6-9 жирных кислот с САЧ подтверждено после сравнения с результатами ELISAанализа с L-тироксином. Хотя оценка регулярной вторичной структуры САЧ с использованием КД показала незначительные изменения после инкубации с омега 3-6-9 жирными кислотами, его третичная структура выявила наблюдаемые колебания. Таким образом, взаимодействие омега 3-6-9 жирных кислот с САЧ приводит к нестабильности и частичным структурным изменениям. Кроме того, согласно результатам молекулярного докинга, аффинность связывания омега-3, омега-6 и омега-9 с субдоменом ІІA САЧ выше, чем с субдоменом ІІIA.

Valojerdi F. M., Farasat A. , Gheibi N. In vitro и in siliko oценка взаимодействия сывороточного альбумина человека с омега-3-6-9 жирными кислотами. Журнал прикладной спектроскопии. 2021;88(6):977.

Цитирование

Список литературы

1. I. Vlasova, A. Saletskii, Russ. J. Phys. Chem. B, 3, No. 6, 976–80 (2009).

2. Z. Tong, J. E. Schiel, E. Papastavros, C. M. Ohnmacht, Q. R. Smith, D. S. Hage, J. Chromatogr. A, 1218, No. 15, 2065–2071 (2011).

3. J. Kang, Y. Liu, M.-X. Xie, S. Li, M. Jiang, Y.-D. Wang, Biochim. Biophys. Acta, 1674, No. 2, 205–214 (2004).

4. T. Hanai, A. Koseki, R. Yoshikawa, M. Ueno, T. Kinoshita, H. Homma, Anal. Chim. Acta, 454, No. 1, 101–108 (2002).

5. V. Lhiaubet-Vallet, Z. Sarabia, F. Boscá, M. A. Miranda, J. Am. Chem. Soc., 126, No. 31, 9538–9539 (2004).

6. M. C. Jiménez, M. A. Miranda, I. Vayá, J. Am. Chem. Soc., 127, No. 29, 10134–10135 (2005).

7. A. Ahmed-Ouameur, S. Diamantoglou, M. Sedaghat-Herati, S. Nafisi, R. Carpentier, H. Tajmir-Riahi, Cell Biochem. Biophys., 45, No. 2, 203–213 (2006).

8. M. Fasano, S. Curry, E. Terreno, M. Galliano, G. Fanali, P. Narciso, et al., IUBMB Life, 57, No. 12, 787–796 (2005).

9. U. Anand, S. Mukherjee, Biochim. Biophys. Acta, 1830, No. 12, 5394–5404 (2013).

10. A. Varshney, P. Sen, E. Ahmad, M. Rehan, N. Subbarao, R. H. Khan, Chirality: The Pharmacological, Biological, and Chemical Consequences of Molecular Asymmetry, 22, No. 1, 77–87 (2010).

11. G. Calviello, S. Serini, Dietary Omega-3 Polyunsaturated Fatty Acids and Cancer, Springer (2010).

12. M. Campagnoli, U. Kragh-Hansen, A. O. Pedersen, A. Amoresano, A. W. Lyon, R. Cesati, et al., Clin. Biochem., 36, No. 8, 597–605 (2003).

13. P. M. Kris-Etherton, W. S. Harris, L. J. Appel, Arteriosclerosis, Thrombosis, and Vascular Biology, 23, No. 2, e20–e30 (2003).

14. A. M. Patwardhan, P. E. Scotland, A. N. Akopian, K. M. Hargreaves, Proc. Natl. Acad. Sci., 106, No. 44, 18820–18824 (2009).

15. N. Gheibi, M. Ghorbani, H. Shariatifar, A. Farasat, PloS One, 14, No. 10, e0224095 (see [16]) (2019).

16. N. Gheibi, M. Ghorbani, H. Shariatifar, A. Farasat, PloS One, 15, No. 3, e0230780 (2020).

17. A. Akya, A. Farasat, K. Ghadiri, M. Rostamian, Genetics and Evolution, 75, 103953 (2019).

18. N. Gheibi, A. Saboury, K. Haghbeen, F. Rajaei, A. Pahlevan, J. Enzyme Inhibition and Med. Chem., 24, No. 5, 1076–1081 (2009).

19. X. Zhang, H. Zhai, R. Gao, J. Zhang, Y. Zhang, X. Zheng, Spectrochim. Acta A: Mol. Biomol. Spectrosc., 121, 724–731 (2014).

20. S. Li, K. Huang, M. Zhong, J. Guo, W.-Z. Wang, R. Zhu, Spectrochim. Acta A: Mol. Biomol. Spectrosc., 77, No. 3, 680–686 (2010).

21. D. Agudelo, P. Bourassa, J. Bruneau, G. Berube, É. Asselin, H.-A. Tajmir-Riahi, PloS One, 7, No. 8 (2012).

22. X. Zhang, L. Li, Z. Xu, Z. Liang, J. Su, J. Huang, et al., PLoS One, 8, No. 3, e59106 (2013).

23. D. Weber, L. Milkovic, S. J. Bennett, H. R. Griffiths, N. Zarkovic, T. Grune, Redox Biol., 1, No. 1, 226–233 (2013).

24. M. Nigen, V. Le Tilly, T. Croguennec, D. Drouin-Kucma, S. Bouhallab, Biochim. Biophys. Acta, 1794, No. 4, 709–715 (2009).

25. C. Nick Pace, S. Trevino, E. Prabhakaran, J. Martin Scholtz, Philos. Transt. Roy. Soc. London B: Biol. Sci., 359, No. 1448, 1225–1235 (2004).

26. E. Lindahl, B. Hess, D. Van Der Spoel, Mol. Model. Ann., 7, No. 8, 306–317 (2001).

27. A. W. Schüttelkopf, D. M. Van Aalten, Acta Crystallogr. Sec. D: Biol. Crystallogr., 60, No. 8, 1355–1363 (2004).

28. W. F. van Gunsteren, X. Daura, A. E. Mark, Encyclopedia of Computational Chemistry, 2, Helva Chimica Acta (2002).

29. A. Farasat, F. Rahbarizadeh, G. Hosseinzadeh, S. Sajjadi, M. Kamali, A. H. Keihan, J. Biomol. Struct. Dynam., 35, No. 8, 1710–1728 (2017).

30. S. Ashoka, J. Seetharamappa, P. Kandagal, S. Shaikh, J. Lumin., 121, No. 1, 179–86 (2006).

31. I. Vekshin, Biofizika, 41, No. 6, 1176–1179 (1996).

32. M. Gokara, V. V. Narayana, V. Sadarangani, S. R. Chowdhury, S. Varkala, D. B. Ramachary, et al., J. Biomol. Struct. Dynam., 35, No. 10, 2280–2292 (2017).

33. R. M. Abreu, H. J. Froufe, M. J. R. Queiroz, I. C. Ferreira, Chem. Biol. Drug Des., 79, No. 4, 530–534 (2012).

34. V. Mohan, A. C. Gibbs, M. D. Cummings, E. P. Jaeger, R. L. DesJarlais, Docking: Successes and Challenges. Curr. Pharm. Des., 11, No. 3, 323–333 (2005).

35. Y. Gou, Z. Zhang, D. Li, L. Zhao, M. Cai, Z. Sun, et al., Drug Deliv., 25, No. 1, 321–329 (2018).

36. N. Shahabadi, S. M. Fili, S. Kashanian, J. Coord. Chem., 71, No. 2, 329–341 (2018).

37. N. Shahabadi, B. Bazvandi, A. Taherpour, J. Coord. Chem., 70, No. 18, 3186–3198 (2017).

38. C. Chang, M. T. Nickerson, J. Food Sci. Technol., 55, No. 8, 2850–2861 (2018).

Источник

Информация

Автор

Valojerdi F. M. Исламский университет Азад
Farasat A. Научно-исследовательский институт профилактики неинфекционных заболеваний, Казвинский университет медицинских наук
Gheibi N. Научно-исследовательский институт профилактики неинфекционных заболеваний, Казвинский университет медицинских наук

Страницы

Год издания

2021

Ключевые слова

Коллекции

Журнал прикладной спектроскопии