КЛОНИРОВАНИЕ И СЕКВЕНИРОВАНИЕ ГЕНА, КОДИРУЮЩЕГО β-ГАЛАКТОЗИДАЗУ БАКТЕРИЙ ARTHROBACTER SULFONIVORANS

КОСТЕНЕВИЧ А. А.; САПУНОВА Л. И.; ЛОБАНОК А. Г.

КЛОНИРОВАНИЕ И СЕКВЕНИРОВАНИЕ ГЕНА, КОДИРУЮЩЕГО β-ГАЛАКТОЗИДАЗУ БАКТЕРИЙ ARTHROBACTER SULFONIVORANS

КОСТЕНЕВИЧ А. А., САПУНОВА Л. И., ЛОБАНОК А. Г.

2015

Путем клонирования в составе плазмиды pJET1.2 фрагментов ДНК, содержащих ген β-галактозидазы (β-gal) бактерий Arthrobacter sulfonivorans ЛФ-ГАЛ, их последующего секвенирования и сравнения с известными последовательностями из базы данных GenBank установлена и депонирована (код доступа KM277894) полная нуклеотидная последовательность гена β-gal.Анализ структуры β-gal бактерий A. sulfonivorans ЛФ-ГАЛ показал, что он состоит из 3132 п. н., которые кодируют 1043 аминокислоты, составляющие субъединицу β-галактозидазы с молекулярной массой 113,6 кДа. Установлено, что β-gal исследуемого штамма в наибольшей степени идентичен генам, кодирующим β-галактозидазы у актинобактерий рода Arthrobacter (66–72 %). Соответствие аминокислотного состава ферментных белков A. sulfonivorans ЛФ-ГАЛ и других представителей рода Arthrobacter составляет 59–95 %.Анализ аминокислотной последовательности ферментного белка в пакете программ BLAST показал, что β-галактозидаза A. sulfonivorans ЛФ-ГАЛ содержит консервативные последовательности, характерные для гликозил-гидролаз 2 семейства.

КОСТЕНЕВИЧ А. А., САПУНОВА Л. И., ЛОБАНОК А. Г. КЛОНИРОВАНИЕ И СЕКВЕНИРОВАНИЕ ГЕНА, КОДИРУЮЩЕГО β-ГАЛАКТОЗИДАЗУ БАКТЕРИЙ ARTHROBACTER SULFONIVORANS. Доклады Национальной академии наук Беларуси. 2015;59(1):96-101.

Цитирование

Список литературы

1. Nath A., Mondal S., Chakraborty S. et al. // Asia-Pac. J. Chem. Eng. 2014. Vol. 9, is. 3. P. 330–348.

2. Panesar P. S., Kumari S., Panesar R. // Enzyme Res. 2010. Vol. 2010. P. 1–16.

3. Husain Q. // Crit. Rev. Biotechnol. 2010. Vol. 30, N 1. P. 41–62.

4. Tang L., Li Z. A., Dong X. X. // J. Ind. Microbiol. Biotechnol. 2011. Vol. 38. P. 471–476.

5. Asraf S. S., Gunasekaran P. // Current trends of ß-galactosidase research and application. Current Research, Technology and Education Topics in Applied Microbiology and Microbial Biotechnology. Microbiology book series. 2010, N 2. P. 880–890.

6. Kastsianevich A. A., Sapunova L. I. // Сб. мат. II Междунар. науч.-практ. конф. молодых ученых «Научные стремления–2011». 2011. Т. 1. С. 200–206.

7. Сапунова Л. И., Костеневич А. А., Лобанок А. Г. и др. // Докл. НАН Беларуси. 2013. Т. 57, № 6. С. 70–74.

8. Сапунова Л. И., Костеневич А. А., Лобанок А. Г. и др. // Докл. НАН Беларуси. 2014. Т. 58, № 4. С. 71–77.

9. Способ получения внеклеточной β-галактозидазы. Патент 15050 РБ. а 20091062; заявл. 14.07.2009; опубл. 28.02.2011.

10. Сапунова Л. И., Костеневич А. А., Лобанок А. Г. и др. // Тр. БГУ, сер. физиол., биохимия и молекул. основы функционирования биосистем. 2013. Т. 8, Ч. 1. С. 224–229.

11. Костеневич А. А., Сапунова Л. И., Лобанок А. Г. // Микробные биотехнологии: фундаментальные и прикладные аспекты. 2014. Т. 6. С. 51–62.

12. Sambrook J., Frittsch E., Maniatis T. // Molecular cloning: a laboratory manual. 2nd ed. New York: Cold Spring Harbor Laboratory Press, 1989. – 2222 p.

13. http://molbiol.ru/protocol/03_05.html#a1

14. http://www.bioinformatics.babraham.ac.uk/projects/fastqc/

15. Bolger A. M., Lohse M., Usadel B. // Bioinformatics. 2014. Vol. 30. P. 2114–2120.

16. Bankevich A., Nurk S., Antipov D. // J. Comp. Biol. 2012. Vol. 19, N 5. P. 455–477.

17. Langmead B., Salzberg S. // Nature Methods. 2012. Vol. 9. P. 357–359.

18. Van Domselaar G. H., Stothard P., Shrivastava S. et al. // Nucleic Acids Res. 2005. Vol. 33. P. W455–459.

19. Altschul S. F., Gish W., Miller W. J. Mol. Biol. 1990. Vol. 215, N 3. P. 403–410.

20. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/refseq/

Источник

Информация

Автор

КОСТЕНЕВИЧ А. А. Институт микробиологии НАН Беларуси, Минск
САПУНОВА Л. И. Институт микробиологии НАН Беларуси, Минск
ЛОБАНОК А. Г. Институт микробиологии НАН Беларуси, Минск

Страницы

96-101

Год издания

2015

Коллекции

Доклады Национальной академии наук Беларуси