Генеративная состязательная нейронная сеть на основе графовых эмбеддингов для de novo дизайна низкомолекулярных ингибиторов фермента KasA микобактерии туберкулеза

Гончар А. В., Фурс К. В., Тузиков А. В., Андрианов А.
2025

Разработана генеративная состязательная нейронная сеть с частичным привлечением учителя, обученная на графовых эмбеддингах и предназначенная для de novo дизайна потенциальных ингибиторов бета-кето- ацил-[ацил-белок-носитель] синтазы I (KasA) - фермента, критически важного для биосинтеза миколовых кислот клеточной стенки микобактерии туберкулеза. Проведено обучение и тестирование созданной нейронной сети на наборе соединений из виртуальной библиотеки малых молекул, содержащих элементы структуры, способные к селективным взаимодействиям с терапевтической мишенью. С помощью разработанной нейронной сети осуществлен de novo дизайн 3637 соединений с последующей оценкой потенциала их ингибиторной активности против белка KasA методами молекулярного докинга. На основе анализа полученных данных отобраны шесть соединений, проявляющих высокое сродство к малонил-связывающему сайту фермента. Предполагается, что идентифицированные соединения формируют перспективные базовые структуры для проведения дальнейших теоретических и экспериментальных исследований по разработке новых эффективных ингибиторов лекарственно-устойчивых форм туберкулеза.

Гончар А. В., Фурс К. В., Тузиков А. В., Андрианов А. Генеративная состязательная нейронная сеть на основе графовых эмбеддингов для de novo дизайна низкомолекулярных ингибиторов фермента KasA микобактерии туберкулеза. Доклады Национальной академии наук Беларуси. 2025;69(1):13-22. https://doi.org/10.29235/1561-8323-2025-69-1-13-22
Цитирование

Список литературы

Похожие публикации

Источник