Новые липофильные конъюгаты флуоресцирующего NBD-пиперазина: синтез, in silico взаимодействие с липидным бислоем и цитохромами P450
Фалетров Я. В.,
Позняк Г. И.,
Яковец П. С.,
Фролова Н. С.,
Шкуматов В. М.
2022
Синтезированы два новых флуоресцирующих производных NBD-пиперазина с липофильными остатками формилхолестерола и гексановой кислоты (соединения 2 и 3 соответственно). Расчетно-теоретическими методами показана их возможность проникать через липидный бислой, а также аффинно связываться с некоторыми цитохромами P450 человека (2 с ланостерол 14α-деметилазой CYP51, 3 c лекарство-превращающими CYP1A1, CYP2D6, CYP3A4; энергия связывания Ebind в диапазоне –14,4…–10 ккал/моль) и микобактерий (2 со стерол-27 гидроксилазой CYP125, 3 с «орфанным» CYP164; Ebind в диапазоне –13,3…–9,1 ккал/моль). Полученные вещества и соответствующие расчетно-теоретические данные будут способствовать приоритезации исследований in vitro для целей исследования функций этих белков.
Фалетров Я. В., Позняк Г. И., Яковец П. С., Фролова Н. С., Шкуматов В. М. Новые липофильные конъюгаты флуоресцирующего NBD-пиперазина: синтез, in silico взаимодействие с липидным бислоем и цитохромами P450. Известия Национальной академии наук Беларуси. Серия химических наук. 2022;58(1):62-67.
https://doi.org/10.29235/1561-8331-2022-58-1-62-67
Цитирование
Список литературы
1. Ishiguro, K. Novel application of 4-nitro-7-(1-piperazinyl)-2,1,3-benzoxadiazole to visualize lysosomes in live cells / K. Ishiguro, T. Ando, H. Goto // Biotechniques. – 2008. – Vol. 45. – P. 467–468. https://doi.org/10.2144/000112912
2. Fan, J. A Two-Photon Fluorescent Probe for Lysosomal Thiols in Live Cells and Tissues / J. Fan, Z. Han, Y. Kang, X. Peng // Sci. Rep. – 2016. – Vol. 6. – P. 19562. https://doi.org/10.1038/srep19562
3. Piperazine-tuned NBD-based colorimetric and fluorescent turn-off probes for hydrogen sulfide / Z. Xu [et al.] // Anal. Methods. – 2018. – Vol. 10. – P. 3375–3379. https://doi.org/10.1039/C8AY00797G
4. Взаимодействие нитробензоксадиазольных производных пиперазина и анилина с бычьим сывороточным альбумином in silico и in vitro / Я. В. Фалетров [и др.] // Журн. Бел. гос. ун-та. Химия. – 2021. – № 2. – С. 25–35. https://doi.org/10.33581/2520-257X-2021-2-25-35
5. In silico моделирование взаимодействия конъюгатов изониазид-стероид с цитохромами Р450 микобактерий и их превращение in vitro в клетках данных микроорганизмов / Я. В. Фалетров [и др.] // Биомед. хим. – 2020. – Т. 66, N 5. – С. 378–385. https://doi.org/10.18097/PBMC20206605378
6. Lomize, A. L. Anisotropic solvent model of the lipid bilayer. 2. Energetics of insertion of small molecules, peptides, and proteins in membranes / A. L. Lomize, I. D. Pogozheva, H. I. Mosberg // J. Chem. Inf. Mod. – 2011. – Vol. 51. – P. 930– 946. https://doi.org/10.1021/ci200020k
Похожие публикации