17 Андрианов А. М. Николаев Г. И. Корноушенко Ю. В. Хуанг Дж. Дзян Ш. Тузиков А. В. ВИЧ-1 белок gp120 антитело N6 ингибиторы проникновения ВИЧ-1 виртуальный скрининг молекулярный докинг молекулярная динамика лекарственные препараты против ВИЧ 2019 2019-09-13 10.29235/1561-8323-2019-63-4-445-456 Доклады Национальной академии наук Беларуси Методами виртуального скрининга и молекулярного моделирования идентифицированы 6 потенциальных пептидомиметиков кросс-реактивного нейтрализующего анти-ВИЧ-1 антитела N6, способных имитировать фармакофорные свойства этого иммуноглобулина путем специфических и эффективных взаимодействий с CD4-связывающим сайтом белка gp120 оболочки вируса. Показано, что ключевую роль во взаимодействии этих соединений с белком gp120 играют многочисленные ван-дер-ваальсовы контакты с консервативными остатками Phe43-полости гликопротеина, критическими для связывания ВИЧ-1 с клеточным рецептором CD4, а также водородные связи с остатком Asp-368gp120, образование которых увеличивает химическое сродство без активации нежелательного аллостерического эффекта. Согласно данным молекулярной динамики, комплексы обнаруженных лигандов с белком gp120 энергетически стабильны и характеризуются более низкими значениями свободной энергии связывания по сравнению с ингибиторами ВИЧ-1 NBD-11021 и DMJ-II-121, использованными в расчетах в качестве контрольных соединений. Идентифицированные соединения могут быть использованы в работах по созданию новых противовирусных препаратов – ингибиторов проникновения ВИЧ-1, блокирующих ранние стадии развития ВИЧ-инфекции. https://www.academjournals.by/publication/2615 https://www.academjournals.by/files/2613