RT - article
SR - Electronic
T1 - Разработка алгоритмов и программных средств классификации кодирующих и некодирующих нуклеотидных последовательностей
JF - Информатика
SP - 2019-02-14
A1 - Закирова В. Р., 
A1 - Сырокваш Д. А., 
A1 - Гилевский С. В., 
A1 - Назаров П. В., 
A1 - Яцков Н. Н., 
YR - 2019
UL - https://www.academjournals.by/publication/18343
AB - Проведено исследование кодирующих и некодирующих нуклеотидных последовательностей референсного генома человека. Разработаны семь моделей векторизации нуклеотидных последовательностей на основе частот моно-, би- и триграммов нуклеотидов, параметров модели частот и позиций сочетаний нуклеотидов (category-position-frequency model), длин последовательностей, корреляционных факторов нуклеотидов, статистических признаков кодирующих и некодирующих участков молекул ДНК. Определены наиболее информативные признаки моделей векторизации c использованием алгоритмов автоматического выбора признаков и классификации на основе методов случайного леса и опорных векторов. Установлено различие кодирующих и некодирующих фрагментов нуклеотидных последовательностей. Ошибка классификации последовательностей с использованием метода случайного леса на наборе из 23 наиболее информативных признаков составила 2,93 %.