<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<xml>
 <records>
  <record>
   <ref-type name="Journal Article">17</ref-type>
   <contributors>
    <authors>
     <author>Kinaytürk N. K.</author>
    </authors>
   </contributors>
   <titles>
    <title>Анализ взаимодействия пропиконазола с ДНК на основе расчетов методом функционала плотности и молекулярного докинга</title>
   </titles>
   <keywords>
    <keyword>пропиконазол</keyword>
    <keyword>теория функционала плотности</keyword>
    <keyword>молекулярный докинг</keyword>
    <keyword>поверхность молекулярного электростатического потенциала</keyword>
    <keyword>колебательные распределения</keyword>
   </keywords>
   <dates>
    <year>2023</year>
    <pub-dates>
     <date>2023-11-25</date>
    </pub-dates>
   </dates>
   <journal>Журнал прикладной спектроскопии</journal>
   <abstract>Теоретический анализ, основанный на структурных и спектральных данных, использован для выяснения механизма молекулярного взаимодействия пропиконазола — фунгицида — с ДНК. Оптимизация, анализ полос колебаний и электронной структуры проведены с использованием теории функционала плотности уровней B3LYP с базисным набором aug-cc-pVDZ. Проведено моделирование молекулярного докинга для определения механизма и способов взаимодействия между пестицидом пропиконазолом и ДНК (ID PDB: 1BNA). Показано, что соединение проявляет реакционную способность и поляризуемость, на что указывает диапазон энергий ВЗМО-НСМО. Анализ поверхности молекулярного электростатического потенциала (МЭП) и поверхности электростатического потенциала молекулы показал, что атомы N6 и N7 обладают отрицательным потенциалом и служат активными центрами для нуклеофильных атак. Аналогичные наблюдения сделаны для атомов кислорода и хлора. Анализ молекулярного докинга показал способность лиганда пропиконазола связываться с ДНК в сайтах, включающих в себя атомы азота, кислорода и хлора, в частности, с взаимодействиями гуанин (G)-цитозин (C). Соответствие результатов MЭП и молекулярной вставки подтверждает сделанные выводы. Результаты дают ценную информацию о механизме повреждения ДНК и токсикологическом воздействии пестицида. В результате анализа молекулярного докинга выявлены изменения в оптимизированной структуре молекулы пропиконазола. Длина связи Cl1–C15, которая изначально составляла 1.73 Å в оптимизированной структуре, пересчитана как 1.77 Å после анализа молекулярного докинга.</abstract>
   <urls>
    <web-urls>
     <url>https://www.academjournals.by/publication/15386</url>
    </web-urls>
    <pdf-urls>
     <url>https://www.academjournals.by/files/15345</url>
    </pdf-urls>
   </urls>
  </record>
 </records>
</xml>
